Una Bula de Sixto IV de 1479 fue el origen de la puesta en escena de la Fundación del Colegio Mayor de Santa Cruz, primera muestra renacentista en nuestra geografía. En la actualidad se ubican en este palacio: la sede rectoral de la Universidad de Valladolid, el Museo de Arte Africano y el Museo de la Universidad de Valladolid. La joya más valiosa de su inventario es su Biblioteca Histórica, dividida en la actualidad en cuatro secciones clave, destacando su sección de manuscritos con su valiosa obra protagonista: El Beato de Valcavado.